第一次入棺:1908年死后第二天慈禧被殓入棺
飞扬跋扈，一改再改陵制，同治5年，咸丰帝的定陵完工。按清制，他的两位皇后慈安、慈禧的陵墓只可在定陵附近选址，并只能建一座皇后陵。当时便定下给两位皇太后建一座陵，棺椁并排奉安。慈禧看了奏折很生气:“哪个陵里葬两个太后，连妃园寝的妃子还都各自为券，这不是明着欺负我们姐妹 ”承修大臣们只好提出，仿照双妃园寝的样式，在陵的后院东西并排各建宝城、宝顶、下建地宫。
不料，慈禧逼问道:“我们是两个太妃吗 谁说我们就不配一人建一陵 ”这是再次打破陵制，但谁敢不听 于是，同治12年三月初九清明节，18岁的同治前往定陵，为咸丰帝行敷士礼和大飨礼后，来到附近的平顶山和菩陀山验看风水。15日，将平顶山改名“普祥峪”，为慈安万年吉地;菩陀山改“菩陀峪”，为慈禧的万年吉地。双陵于当年8月同时动工，于光绪5年6月同时完工，耗时6年，耗银500多万两。
太后慈禧出土的恐怖景象，当年的风光已经不再，死后不过是一堆黄土。三大殿几乎拆了再建，“超级豪华”竟然压倒紫禁城！
双陵的建制本来一样，但慈安死后，慈禧一定要压倒慈安的机会来了。光绪21年8月，东陵守护大臣为讨好慈禧，上奏朝廷说慈禧陵因连年雨水，多有糟朽，急需修整。慈禧命亲信庆亲王和兵部尚书荣禄为承办大臣。结果，陵内建筑无一不修，大殿和东西配殿都从原来的揭瓦维修改为拆后重建!此次大修工程浩大，到光绪25年已拨款150万两，以后的款项更是个无底之谜。中间，八国联军侵华使工程停顿，慈禧回京后，再次来到工地亲自检查。1908年10月18日，工程在历时13年重修后终于完工(巧的是4天后慈禧去世)。仅三殿所用的叶子金达4592两!陵内的丹陛石，为高浮雕加透技法雕成，图案为“龙在下，凤在上”。隆恩殿周围的69块汉白玉板处处雕成“凤引龙追”，74根望柱头打破历史上一龙一凤的格式，均为“一凤压两龙”，暗示她的两度垂帘。
光绪三十四年(1908年)十月二十二日未时三刻，慈禧走完了她74年的人生路程，撒手人寰。当天下午4时30分，掌仪司首领太监用鹅黄吉祥轿将慈禧的遗体从西苑仪銮殿抬出，5时15分到皇极殿，放在回床上。
第二天上午8时5分，在隆裕皇太后和瑾妃的敬视下，慈禧的遗体被殓入了棺内。宣统元年(1909年)十月初四日巳时，慈禧的梓宫葬入菩陀峪定东陵地宫。
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