新版《射雕英雄传》迎来了大结局。随着郭靖和黄蓉误会的解除，黄蓉引诱傻姑说出当日桃花岛的真相，原来是杨康设计并利用欧阳锋杀害了江南五怪，欧阳锋当时并不知道杨康就是杀害自己儿子欧阳克，还误会是郭靖，收杨康为徒。得知真相的欧阳锋在眼看杨康中毒之后，置之不理，最终杨康惨死铁枪庙外。
黄蓉了为了救柯镇恶，挺身而出，不仅将杀害江南五怪的真相找出，还救了柯镇恶一命，自己却被欧阳锋带走下落不明。得知真相的郭靖和丐帮弟子到处寻找黄蓉的下落，但是几个月来一点消息也没有;于是郭靖决定先回蒙古看望母亲，并且告诉华筝若是找不到黄蓉便终身不娶，若是找到黄蓉就会履行自己的诺言和华筝结婚。
后来成吉思汗封郭靖为将军率领三万将士攻打撒麻尔罕城，在黄蓉的帮助下，一举攻下城池，并且活捉了完颜洪烈，性格刚烈的完颜洪烈抹刀自杀，郭靖也算是为父报仇了。另外，郭靖本想趁此机会向成吉思汗提出辞婚，却没想到看到蒙古军在杀害城里的无辜百姓，为了那些百姓，郭靖冒死请求留下了他们的性命。嘴笨的郭靖却不知如何解释，黄蓉伤心离去。
郭靖一路追出去，却没想到在沙漠听到欧阳锋的呼救声，原来欧阳锋陷在了流沙里，为了得知黄蓉的下落，郭靖救起了欧阳锋，却没想到欧阳锋告诉他黄蓉已经死了。伤心欲绝的郭靖跳进流沙，欧阳锋为了九阴真经的翻译救起了他，将他带走;后来郭靖在欧阳锋的水里下毒逃回蒙古，但也因此一蹶不振，整日就只知道喝酒买醉，忘记痛苦。
成吉思汗打算去攻打大金的残兵败将，却给了郭靖他们三人一人一个锦囊，但是要他们在攻打下大金之后才能打开。郭靖跟母亲说了之后，郭母坚持要打开锦囊才发现原来成吉思汗是要攻打大宋，身为宋人，决不能做卖国求荣之事，郭靖和郭母决定离开大漠，却没想到被华筝听到他们的对话去向成吉思汗告状，郭母为了不成为郭靖的负担自杀身亡。
哲别和拖雷放走了郭靖，郭靖回到中原遇见了洪七公，和洪七公一起去往华山，在中途偶遇欧阳锋，跟随欧阳锋的同时惊喜的发现黄蓉并没有死。原来黄蓉是为了骗欧阳锋进流沙才丢下了自己的貂裘，欧阳锋则在倒着练九阴真经，已然疯了，连自己是谁都不知道。华山论剑黄药师也到场，郭靖分别和黄药师、洪七公对战，只要郭靖过了他们的三百招就算他赢。
黄蓉沉浸在郭靖成为天下第一的时候欧阳锋突然出现，郭靖、黄药师、洪七公三个人合起来都打不过他，武学奇才的欧阳锋倒着练九阴真经也练成了。幸好黄蓉的聪明机智才得以逃脱。后来，郭靖收到华筝传来的消息成吉思汗要攻打襄阳，于是和黄蓉去往襄阳通知，在半路的客栈却遇到了跳崖未死的穆念慈，穆念慈已经生下了她与杨康的儿子，郭靖为他取名杨过。
成吉思汗最终死去，临死前还念叨着天下，天下，看来真是应验了完颜洪烈临死前的那句话：所有人都在天下的掌控之中，无论是哪国的帝王，最终都会被它吞噬，谁也斗不过它，它才是真正的霸主;得到了天下又如何，最终还不是天下的俘虏!
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